Alkohol, merokok, dan stres—dalam tubuh yang mengalami iritasi ini, sel-sel yang bertanggung jawab untuk mempertahankan kehidupan tampaknya berperang yang tidak pernah berakhir. Karena kekurangan pekerja yang parah, Sel Darah Merah AA2153 harus cepat belajar memberikan oksigen dan mengumpulkan karbon dioksida, bahkan dalam kondisi berbahaya. Sementara itu, Sel Darah Putih U-1196 harus melakukan perannya dengan menangani kuman dan virus selama situasi yang mengancam jiwa. Di tengah krisis tersebut, mereka harus bekerja sama untuk menjaga kesehatan tubuh, meski tidak tahu apakah pengorbanan mereka akan sia-sia. Sel di Tempat Kerja! Code Black mengambil pendekatan yang berbeda dengan menunjukkan sisi yang lebih keras dari pekerjaan yang dilakukan sel kita.